2008 yılında başlatılan Maltepe Üniversitesi Yazılım Mühendisliği programı, projeye dayanan, problem çözme becerilerini geliştirmeyi hedefleyen ve grup çalışmasına dayanan bir programdır. Bu yönleriyle, Türkiye’de ve dünyada yazılım sektöründe aranan nitelikte elemanlar yetiştirmektedir. Yazılım mühendisliği eğitiminde dersler, takım çalışması deneyimi kazandıracak, güncel konularla ilgili bir problemin dönem projesi olarak ele alındığı yeni bir yaklaşımla verilmektedir.
Maltepe Üniversitesi Yazılım Mühendisliği programı, IEEE/ACM Software Engineering 2004 müfredat kılavuzunda önerilen ana hatları takip ederek geliştirilmiştir. Programın geliştirilmesinde, sadece ana hatları izlemekle yetinmeyip aynı zamanda Türkiye’deki yazılım uygulamalarının gereksinimleri ve sınırlılıkları da dikkate alınmıştır.
Ortak eğitim-öğretim modeli ile çift anadal (2. diploma), yandal (sertifika) ve yatay geçişle bölüm değiştirme olanakları sağlanmaktadır.